Marion uusin seikkailu ei sijoitu tällä kertaa sienivaltakuntaan, vaan värikkääseen trooppiseen saareen, missä on aina kesä. Mario matkustaa aurinkoiselle saarelle nauttiakseen ansaitsemastaan lomasta, mutta juuri kun hän laskeutuu saarelle, hän saa tietää rauhallisen saaren muuttuneen saastuneeksi paikaksi. Näyttää siltä, että salaperäinen tuholainen on saastuttanut saarta ja jos se ei olisi jo tarpeeksi huono asia, niin sen lisäksi tämä sama tuholainen muistuttaa kummasti Mariota! Rentouttavan loman sijasta Mario päätyykin puhdistamaan tämän sotkun ja etsimään käsiinsä oikean roiston.
Mario saa mukaansa erikoisen vesipumpun, jonka avulla hän saa vapaasti tehdä hänelle tyypillisiä akrobaattisia hyppyjä ja liikkeitä ja samalla kukistaa vihollisia, pomppia ilmassa leijuvien tasanteiden päällä, ratkaista haastavia arvoituksia ja puhdistaa saastuneet paikat liasta. Mutta siivoaminen ja maineensa puhdistaminen eivät olekaan mitään helppoja hommia, joten hänen täytyy oppia käyttämään vesipumppuaan täydellisesti saadakseen selville, ketä todellisuudessa on kaiken tämän sotkun takana ja täten palauttaa saari alkuperäiseen, puhtaaseen tilaansa. Peli sisältää tuttuja vihollisia ja perinteistä hyppimistä, pomppimista, korkeita hyppyjä ja aitoa Mario-meininkiä täysin uudessa ympäristössä täysin uuden vesipumpun kanssa.
Miten tason voi selvittää: Kerää Shine-palasia, kukista vihollisia ja puhdista liat maastosta edetäksesi pelissä.
Hahmot: Mario, Prinsessa, Yoshi, saarenasukkaat ja uusia sekä tuttuja vihollisia.
Erikoisvoimat/aseet/liikkeet/ominaisuudet: Mario omaa uusia hyppyjä ja tekniikoita, kuten naruilla kävelyn, roikkuvissa häkeissä kiipeämisen ja maanalaisen tunnelijärjestelmän tutkimisen.